Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme8Q715T0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme8Q715T0 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms