Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms