Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms