Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms