Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pram1Q6BCL1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms