Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Pdzrn3Q69ZS0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Pdzrn3Q69ZS0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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