Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Atg9aQ68FE2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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