Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
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Ccdc18Q640L5 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Ccdc18Q640L5 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Ccdc18Q640L5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Ccdc18Q640L5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Ccdc18Q640L5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
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Ccdc18Q640L5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Ccdc18Q640L5 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Ccdc18Q640L5 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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