Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln3Q61124 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln3Q61124 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln3Q61124 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln3Q61124 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln3Q61124 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln3Q61124 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln3Q61124 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln3Q61124 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln3Q61124 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln3Q61124 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln3Q61124 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln3Q61124 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln3Q61124 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Cln3Q61124 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln3Q61124 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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Cln3Q61124 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln3Q61124 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln3Q61124 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln3Q61124 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln3Q61124 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln3Q61124 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln3Q61124 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln3Q61124 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln3Q61124 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Cln3Q61124 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln3Q61124 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln3Q61124 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln3Q61124 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Cln3Q61124 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Cln3Q61124 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Cln3Q61124 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Cln3Q61124 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Cln3Q61124 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Cln3Q61124 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Cln3Q61124 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms