Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf1Q61069 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms