Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CttnQ60598 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CttnQ60598 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CttnQ60598 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms