Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms