Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Slc5a6Q5U4D8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc5a6Q5U4D8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms