Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Trim38Q5SZ99 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Trim38Q5SZ99 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Trim38Q5SZ99 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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