Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms