Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms