Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms