Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim41Q5NCC3 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms