Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Esf1Q3V1V3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Esf1Q3V1V3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms