Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms