Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms