Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Skap2Q3UND0 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms