Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Tmem253Q3UNB8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Tmem253Q3UNB8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Tmem253Q3UNB8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Tmem253Q3UNB8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Tmem253Q3UNB8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Tmem253Q3UNB8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Tmem253Q3UNB8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Tmem253Q3UNB8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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