Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp19Q3UJD6 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms