Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf224Q3UIW8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms