Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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Nkx6-3Q3UHX8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Nkx6-3Q3UHX8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Nkx6-3Q3UHX8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Nkx6-3Q3UHX8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Nkx6-3Q3UHX8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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