Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms