Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms