Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Usp39Q3TIX9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Usp39Q3TIX9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Usp39Q3TIX9 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Usp39Q3TIX9 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Usp39Q3TIX9 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Usp39Q3TIX9 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Usp39Q3TIX9 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Usp39Q3TIX9 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Usp39Q3TIX9 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp39Q3TIX9 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms