Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

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Length 128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2afvQ3THW5 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afvQ3THW5 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afvQ3THW5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afvQ3THW5 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afvQ3THW5 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afvQ3THW5 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afvQ3THW5 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afvQ3THW5 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afvQ3THW5 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afvQ3THW5 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afvQ3THW5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afvQ3THW5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afvQ3THW5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afvQ3THW5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afvQ3THW5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afvQ3THW5 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afvQ3THW5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afvQ3THW5 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afvQ3THW5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afvQ3THW5 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afvQ3THW5 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afvQ3THW5 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afvQ3THW5 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afvQ3THW5 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afvQ3THW5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afvQ3THW5 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afvQ3THW5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afvQ3THW5 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afvQ3THW5 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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