Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms