Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1aQ2LKU9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms