Protein–RNA interactions for Protein: Q2HXL6

Edem3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edem3Q2HXL6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Edem3Q2HXL6 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Edem3Q2HXL6 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Edem3Q2HXL6 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Edem3Q2HXL6 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Edem3Q2HXL6 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Edem3Q2HXL6 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Edem3Q2HXL6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Edem3Q2HXL6 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Edem3Q2HXL6 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Edem3Q2HXL6 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Edem3Q2HXL6 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Edem3Q2HXL6 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Edem3Q2HXL6 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Edem3Q2HXL6 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Edem3Q2HXL6 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Edem3Q2HXL6 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Edem3Q2HXL6 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Edem3Q2HXL6 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Edem3Q2HXL6 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Edem3Q2HXL6 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Edem3Q2HXL6 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Edem3Q2HXL6 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Edem3Q2HXL6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Edem3Q2HXL6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Edem3Q2HXL6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Edem3Q2HXL6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms