Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Fam178bQ24JP3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam178bQ24JP3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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