Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms