Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms