Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Perm1Q149B8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms