Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms