Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms