Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms