Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms