Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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