Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm3Q08189 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms