Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms