Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
F13bQ07968 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
F13bQ07968 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
F13bQ07968 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
F13bQ07968 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms