Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms