Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms