Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smarcad1Q04692 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms