Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Nf1Q04690 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms