Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Runx1Q03347 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms